1. 入內湖院區公車：聯營28、0東、278、284‧286、521、551、617、645、903、紅29、藍20、藍27、市民小巴10，繞駛時間為AM8：00-PM9：30(因本院地幅遼闊，敬請多利用直達院區之公車)，若預搭乘低地板公車者可至台北等公車APP查詢相關資訊。

2. 內湖院區周邊公車：214、256、286、630、652、679、小3、棕9南京幹線、1801國光客運基隆-國立護院(請於「國防醫學中心」下車，步行約十分鐘)。

3. 捷運：捷運板南線「昆陽站」下車，可於4號出口下車搭乘本院免費接駁車。「南港站」下車，於1號或2號出口對向公車站牌，搭乘本院免費接駁車。

4.松山火車站：於松山後火車站松山慈祐宮前可搭乘本院免費之接駁車。