本院成立於民國35年,前身為台灣陸軍801總醫院,名稱 由台灣陸軍醫院→聯勤第五總醫院→陸海空軍第一總醫院→陸軍第一總醫院→三軍總醫院遞嬗而來。 民國56年改制為三軍總醫院,57年於汀州路展開作業。 民國92年改隸為國防醫學院直屬教學醫院。 民國89年08月29日搬遷內湖院區,汀州院區則繼續留用提供門診與急診服務台北市南區、台北縣雙和區民眾,信守對地區就醫民眾逾30年醫療照護之承諾。
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本院成立於民國35年,前身為台灣陸軍801總醫院,名稱 由台灣陸軍醫院→聯勤第五總醫院→陸海空軍第一總醫院→陸軍第一總醫院→三軍總醫院遞嬗而來。