| 小兒部發展史
國防醫學院前身為「北洋軍醫學堂」，創立於1902年，是我國軍事院校中歷史最悠久的學府。1947年6月1日，國防醫學院在上海江灣與十三個相關單位合併組成，並於1949年遷至臺北水源地，以陸軍八○一總醫院為教學醫院，成為我國軍事醫學教育的重要機構。
三軍總醫院前身為陸軍八○一總醫院，經過多次更名後，於1967年正式改制為「三軍總醫院」，並遷至水源地營區，開啟我國軍醫醫療服務的新篇章。現今，三軍總醫院隸屬國防醫學院的教學醫院，提供軍人、健保民眾及一般民眾的醫療服務之外，也肩負教學與研究的職責。
為了照顧軍眷兒童，陸軍總醫院於1952年設立小兒科，為當時台灣少數設有兒科分科的教學醫院之一。小兒科創始時隸屬內科部，病床數十張，負責為14歲以下孩童提供醫療服務。1979年，小兒科獨立設科，成立小兒部，並依據醫學發展潮流，成立了小兒心臟科、小兒感染免疫科、一般兒科和新生兒科四個次專科。
| 1985年 |
本部成立新生兒暨小兒加護中心，提供加護病床6床及觀察病床2床，提升早產及重症患童的醫療品質。 |
| 2000年 |
隨著三軍總醫院搬遷至內湖，新生兒及兒科病房進行全面整建，並設立兒科加護病房。 |
| 2016年 |
小兒暨新生兒加護中心新增超音波檢查及低溫療法等先進診療技術。 |
| 2020年 |
部門擴編至15位主治醫師，並加入台灣新生兒照護網，成為具國際認證的新生兒醫療單位。 |
| 榮譽事蹟
| 2015年 |
醫學中心兒科滿意指標獲得五項前三名 |
| 2019年 |
國家醫療品質獎 (擬真情境銅獎)
醫策會SDM醫學中心實踐績優獎(田炯璽醫師)
陳烱霖優秀論文獎 (林建銘醫師) |
| 2020年 |
兒科醫學會年輕研究者獎 (王德勳醫師) |
| 2024年 |
陳烱霖優秀論文獎 (朱君浩醫師)
兒科醫學會年輕研究者獎 (何昇遠醫師) |
| 三軍總醫院小兒部歷屆主任
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任期
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主任
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1952-1957
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聶重恩
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1958-1959
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于秉溪
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1959-1973
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吳文錦
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1973-1976
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皮德輝
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1976-1980
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方 晃
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1980-1985
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趙治中
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1985-1995
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朱夢麟
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1995-1998
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陳遠浩
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1998-2001
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喻永生
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2001-2004
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錢新南
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2004-2011
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王志堅
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2011-2013
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陳錫洲
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2013-2015
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王志堅
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2015-2017
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黃清峯
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2017-2024
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陳錫洲
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2024-
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林建銘
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