歷史沿革
民國41年陸軍第一總醫院北投分院成立。
民國62年成立汀洲院區急性病房。
民國74年在三總前院長尹在信先生的協助下，成立國內首創之生物精神醫學研究室持續在國內外發表相關研究成果
也在國內生物精神醫學領域居於領先地位，並持續進行役男選兵精神醫學之研究。
民國75年開始投入苗栗精神醫療網工作，使原本毫無精神醫療設施及人員的地區，建立為恭紀念醫院精神部
且協助該院具備訓練專業精神科醫師之能力，解決苗栗地區精神醫療工作需求。
民國76年精神科奉令擴編為精神醫學部，下設「一般及軍陣精神科」、「生物精神科」及「兒童暨青少年精神科」
及臨床心理、社會工作、職能治療三科室，使組織結構漸具現代精神醫學模式。
同年，北投八三一醫院亦改制為國軍八一八醫院(現為三軍總醫院北投分院)
民國79年後成立日間留院病房。
民國89年底醫院搬遷至國醫中心現址，新建空間硬體設施充足之精神醫學大樓
全體工作人員戮力完成醫院「全新三總、全心服務」「團隊醫療、全人照顧」「立足臺灣、放眼世界」之願景。
民國89至92年期間，亦曾接下整個金門地區精神醫療業務，建立急、慢性病房及日間醫院
並建構金門地區完整之精神醫療體系、解決精神疾病預防及治療之臨床服務工作。
民國92年精神醫學大樓20病房成立，本部急性病房床位數擴增至118床，綜合醫院精神科急性病床數之冠。
同年，SARS疫情爆發，本部配合防疫作業，將急性病房改為SARS隔離病房，一心齊力，獲各級長官肯定。
民國97年成立自殺防治中心及藥酒癮治療中心，服務高危險自殺個案與藥酒癮患者。
民國108年更成立心智科學中心，得以提供在精神科藥物治療及心理治療之外的選擇
其中即包括重複性經顱磁刺激(Repetitive transcranial magnetic stimulation, rTMS)等非侵入生理治療方式。
民國111年舉辦昭錥講堂揭牌儀式，紀念國軍精神科開山祖師爺孔昭錥先生。
民國112年更進一步引進尖端神經精神檢查設備如近紅外光腦功能儀(functional near-infrared spectroscopy, fNIRS)
讓病人與家屬能更直觀的理解精神疾病相關之腦部功能影響，提升對精神疾病規則治療以降低功能慢性退化的了解與重視。
組織架構
本部由曾念生主任領導，編制含一般及軍陣精神科、心身精神醫學科與兒童及青少年精神科，並有任務編組之社區精神科；目前共有14位主治醫師(含1位生物及解剖學教授同時有精神專科醫師資格之主治醫師、1位國外進修博士學位主治醫師、2位補服隊勤之主治醫師及1位至他院進修兒童及青少年精神醫學次專科之主治醫師)，12位住院醫師，3位專科護理師，10位臨床心理師、6位精神科社工師、9位職能治療師及7位日間病房個案管理師。
教學與研究成果
教學：本部負責醫學系實習醫學生、畢業後一般醫學訓練(PGY)學員及精神科專科醫師之訓練，依各階段學生、學員之需求，定有完整之教育訓練計畫及核心能力要求，在主治醫師及教學團隊的督導下使學生、學員實際參與臨床工作、落實全人醫療理念並從中熟悉精神醫學之各項診療技能，另外，本部亦分別通過老年精神醫學及成癮兩項次專科醫師之訓練醫院資格，並且透過衛福部住院醫師審議委員會(Resident Review Committee, RRC)評鑑之機制，與三總北投分院進行教學訓練之合作。
研究：自2016~2000年獲得三總民診基金計畫21件、國防計畫12件；SCI或SSCI文章發表計有180篇，歷年以來，多次獲得院內研究績效前三名之殊榮。
硬體設備及醫療服務特色
本部提供院內各項精神醫療服務之門、急、會診、急性病房(118床)住院及日間留院(100床)服務，提供役男體檢服務。現設有內湖與汀州院區門診，亦有主治醫師至本院分院與其他醫院支援門診。本部亦成立自殺防治中心、藥酒癮治療中心及心智科學中心。前後獲得國家品質標章及多項品管圈獎項之肯定。心智科學中心成立之後得以提供病患在精神科藥物治療及心理治療之外的選擇，其中，重複性經顱磁刺激(Repetitive transcranial magnetic stimulation, rTMS)等先進之生理治療治療方式之施作量快速成長中。另外，本部自109年10月起於內湖院區開設自費心理治療門診、兒童青少年腦波注意力檢測與生理回饋治療，為民眾服務。
未來發展目標
為因應社會需求，長期照護、老年精神醫學、身心醫學、社區精神醫學、成癮精神醫學及司法精神醫學亦為本部發展重點，此外，亦將透過分子生物學、藥理學、腦影像學、精神電生理學、大數據研究與人工智慧科學等之運用，拓展本部精神醫學之研究領域。
歷任部科主任
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任期
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主任
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63年09月-72年11月
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孔昭錥
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72年11月-75年07月
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林文隆
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75年07月-91年08月
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陸汝斌
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91年08月-94年08月
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夏一新
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94年08月-97年02月
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林為文
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97年02月-104年3月
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黃三原
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104年3月-110年3月
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葉啟斌
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精神醫學部重大事記
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年代
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大事記要(含榮譽事蹟)
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民國62年
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成立汀州院區急性病房
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民國74年
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成立生物精神醫學研究室
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民國75年
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投入苗栗精神醫療網
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民國76年
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擴編為精神醫學部
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民國79年
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成立日間留院病房
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民國89年底
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搬遷至國醫中心現址
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民國89至92年期間
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協助金門地區精神醫療業務
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民國97年
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成立自殺防治中心及藥酒癮治療中心
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民國108年
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成立心智科學中心
(經顱磁刺激治療、經顱微電流刺激治療
心律變異率檢測)
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民國109年
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設置心理師自費門診
(身心健康諮詢；身心功能分析與衡鑑；身心壓力治療；睡眠諮詢)
設置社工師自費門診
(深度關係創傷與修復家庭諮商)
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